以下类群的演化树根部： 生物 (biota)
- 生物 (biota)（2,235,076种）
- 古菌和真核生物〔说明类群〕 →（2,175,434种）
- ETACKLE 演化支〔说明类群〕 →（2,175,409种）
- TACKLE 演化支〔说明类群〕 →（2,174,718种）
- LE 演化支〔说明类群〕 →（2,174,421种）
- TACK 古菌类群〔说明类群〕 (TACK group) →（297种）
- 甲烷杆菌门 (Euryarchaeota) →（691种）
- 未命名类群 59815 →（545种）
- 未命名类群 59670 →（146种）
- TACKLE 演化支〔说明类群〕 →（2,174,718种）
- DPANN 古菌类群〔说明类群〕 (DPANN group) →（25种）
- 未命名类群 59650 →（19种）
- Micrarchaeota →（6种）
- Candidatus Mancarchaeum acidiphilum
- 未培养的 euryarchaeote VAL90〔说明类群〕 (uncultured euryarchaeote VAL90)
- Candidatus Micrarchaeum acidiphilum ARMAN-2
- Candidatus Micrarchaeum acidiphilum ARMAN-1
- 未培养的 euryarchaeote Alv-FOS5〔说明类群〕 (uncultured euryarchaeote Alv-FOS5)
- 未培养的 euryarchaeote VAL31-1〔说明类群〕 (uncultured euryarchaeote VAL31-1)
- ETACKLE 演化支〔说明类群〕 →（2,175,409种）
- 细菌〔域〕 (Eubacteria) →（59,642种）
- 未命名类群 2782 →（56,862种）
- 未命名类群 2882 →（56,762种）
- 未命名类群 16662 →（42,982种）
- MB-A2-108 →（3种）
- Nitriliruptoria →（11种）
- OPB41 →（2种）
- 未命名类群 2883 →（13,762种）
- Olegusella massiliensis
- Coriobacteriia 细菌〔说明类群〕 (Coriobacteriia bacterium)
- OPB54 →（3种）
- 未命名类群 2791 →（88种）
- Thermolithobacterales →（2种）
- 林诺脊索菌纲 (Limnochordia) →（2种）
- D8A-2 →（2种）
- 未培养的 Moorella 类群细菌〔说明类群〕 (uncultured Moorella group bacterium)
- Candidatus Borkfalkia ceftriaxoniphila
- 铁还原型细菌富集培养克隆 HN-HFO75〔说明类群〕 (iron-reducing bacterium enrichment culture clone HN-HFO75)
- 未命名类群 2882 →（56,762种）
- 候选门 JS1〔说明类群〕 (Candidate division JS1) →（8种）
- Candidatus Caldatribacterium →（2种）
- 未培养的细菌 UASB TL94〔说明类群〕 (uncultured bacterium UASB TL94)
- 细菌富集培养克隆 AOM-SR-B16〔说明类群〕 (bacterium enrichment culture clone AOM-SR-B16)
- 苯矿化联合体克隆 SB-45〔说明类群〕 (benzene mineralizing consortium clone SB-45)
- 苯矿化联合体克隆 SB-15〔说明类群〕 (benzene mineralizing consortium clone SB-15)
- 未培养的烃类渗漏区的细菌 GCA018〔说明类群〕 (uncultured hydrocarbon seep bacterium GCA018)
- 未培养的烃类渗漏区的细菌 GCA025〔说明类群〕 (uncultured hydrocarbon seep bacterium GCA025)
- 候选门 WS3〔说明类群〕 (Candidate division WS3) →（10种）
- 未培养的土壤的细菌 PBS-III-9〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-III-9)
- 未培养的 Latescibacteria 细菌〔说明类群〕 (uncultured Latescibacteria bacterium)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-III-30〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-III-30)
- 未培养的土壤的细菌 PRR-10〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PRR-10)
- 盐沼的克隆 LCP-67〔说明类群〕 (saltmarsh clone LCP-67)
- 未培养的细菌 mle1-16〔说明类群〕 (uncultured bacterium mle1-16)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-III-32a〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-III-32a)
- 未培养的土壤的细菌 PRR-12〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PRR-12)
- 未鉴定的细菌 wb1 H11〔说明类群〕 (unidentified bacterium wb1 H11)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-II-5〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-II-5)
- 未培养的〔说明类群〕 (uncultured) →（34种）
- Psylla pyricola 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Psylla pyricola)
- 龙虾的肠道的细菌 ABHa1〔说明类群〕 (lobster gut bacterium ABHa1)
- Euscepes postfasciatus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Euscepes postfasciatus)
- Enterobacteriaceae 细菌 MK1〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium MK1)
- Enterobacteriaceae 细菌富集培养克隆 PTmrs12〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium enrichment culture clone PTmrs12)
- Columbicola bacillus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Columbicola bacillus)
- Pedicinus badii 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Pedicinus badii)
- Metamasius hemipterus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Metamasius hemipterus)
- Haematomyzus elephantis 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Haematomyzus elephantis)
- Anomoneura mori 的 Y- 共生体〔说明类群〕 (Y-symbiont of Anomoneura mori)
- Rhynchophorus palmarum 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Rhynchophorus palmarum)
- Trichobius yunkeri 的 Arsenophonus 胞内共生体〔说明类群〕 (Arsenophonus endosymbiont of Trichobius yunkeri)
- Erium globosum 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Erium globosum)
- Vryburgia amaryllidis 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Vryburgia amaryllidis)
- Columbicola exilicornis 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Columbicola exilicornis)
- Sphenophorus abbreviata 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Sphenophorus abbreviata)
- Hylobius abietis 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Hylobius abietis)
- Rhynchophorus ferrugineus
- Yuccaborus frontalis 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Yuccaborus frontalis)
- Cosmopolites sordidus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Cosmopolites sordidus)
- Metamasius callizona 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Metamasius callizona)
- Hylobius transversovittatus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Hylobius transversovittatus)
- Dysmicoccus neobrevipes 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Dysmicoccus neobrevipes)
- Cacopsylla myrthi 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Cacopsylla myrthi)
- Columbicola masoni 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Columbicola masoni)
- Enterobacteriaceae 细菌富集培养克隆 PTmrs11〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium enrichment culture clone PTmrs11)
- Pseudococcus comstocki 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Pseudococcus comstocki)
- Columbicola extinctus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Columbicola extinctus)
- Trioza magnoliae 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Trioza magnoliae)
- Candidatus Puchtella pedicinophila
- γ-变形菌 128〔说明类群〕 (gamma proteobacterium 128)
- Columbicola fortis 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Columbicola fortis)
- Scyphophorus yuccae 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Scyphophorus yuccae)
- Columbicola elbeli 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Columbicola elbeli)
- 未命名类群 2718 →（13种）
- Candidatus Carsonella →（12种）
- Candidatus Carsonella ruddii
- Psylla floccosa 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Psylla floccosa)
- Cecidotrioza sozanica 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Cecidotrioza sozanica)
- Pachypsylla celtidismamma 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Pachypsylla celtidismamma)
- Candidatus Carsonella ruddii PC 分离株 NHV〔说明类群〕 (Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV)
- Paratrioza cockerelli 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Paratrioza cockerelli)
- Candidatus Carsonella ruddii CS 分离株 Thao2000〔说明类群〕 (Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000)
- Psylla pyricola 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Psylla pyricola)
- Candidatus Carsonella ruddii HT 分离株 Thao2000〔说明类群〕 (Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000)
- Anomoneura mori 的 X- 共生体〔说明类群〕 (X-symbiont of Anomoneura mori)
- Candidatus Carsonella ruddii HC 分离株 Thao2000〔说明类群〕 (Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000)
- Trioza magnoliae 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Trioza magnoliae)
- Candidatus Zinderia insecticola
- Candidatus Carsonella →（12种）
- Milano-WF1B-44 →（2种）
- Candidatus Cryosericota →（4种）
- Izhakiella →（2种）
- Shimwellia →（2种）
- 候选门 KB1〔说明类群〕 (Candidate division KB1) →（12种）
- Acetothermia 克隆 OPB14〔说明类群〕 (Acetothermia clone OPB14)
- 未培养的细菌 GR-296.II.45〔说明类群〕 (uncultured bacterium GR-296.II.45)
- 未培养的细菌 KTK 36〔说明类群〕 (uncultured bacterium KTK 36)
- 未培养的 KB1 类群细菌〔说明类群〕 (uncultured KB1 group bacterium)
- 未鉴定的真细菌克隆 OctSpA1-106〔说明类群〕 (unidentified eubacterium clone OctSpA1-106)
- 未培养的细菌 KTK 32〔说明类群〕 (uncultured bacterium KTK 32)
- 未培养的 KB1 类群细菌 Medee 0001〔说明类群〕 (uncultured KB1 group bacterium Medee 0001)
- 细菌 EM-19〔说明类群〕 (bacterium EM-19)
- 未培养的细菌 KTK 41〔说明类群〕 (uncultured bacterium KTK 41)
- 未培养的细菌 KTK 14〔说明类群〕 (uncultured bacterium KTK 14)
- 未培养的 Acetothermia 细菌〔说明类群〕 (uncultured Acetothermia bacterium)
- 未培养的细菌 KTK 27〔说明类群〕 (uncultured bacterium KTK 27)
- Arenicellaceae →（15种）
- Arenicella →（14种）
- Olavius ilvae Gamma 1 胞内共生体〔说明类群〕 (Olavius ilvae Gamma 1 endosymbiont)
- Inanidrilus leukodermatus 的 γ-变形菌胞内共生体 1〔说明类群〕 (gamma proteobacterium endosymbiont 1 of Inanidrilus leukodermatus)
- Stilbonema majum 的体表共生体〔说明类群〕 (ectosymbiont of Stilbonema majum)
- Olavius loisae 胞内共生体 1〔说明类群〕 (Olavius loisae endosymbiont 1)
- Arenicella chitinivorans
- Inanidrilus makropetalos 的 γ-变形菌胞内共生体 1〔说明类群〕 (gamma proteobacterium endosymbiont 1 of Inanidrilus makropetalos)
- Arenicella xantha
- Eubostrichus topiarius 相关的细菌 2 III 25〔说明类群〕 (Eubostrichus topiarius associated bacterium 2 III 25)
- Laxus cosmopolitus 相关的细菌〔说明类群〕 (Laxus cosmopolitus associated bacterium)
- Inanidrilus leukodermatus 的硫氧化型胞内共生体〔说明类群〕 (Sulfur-oxidizing endosymbiont of Inanidrilus leukodermatus)
- Eubostrichus topiarius 相关的细菌 1〔说明类群〕 (Eubostrichus topiarius associated bacterium 1)
- Eubostrichus topiarius 相关的细菌 3 IV 19〔说明类群〕 (Eubostrichus topiarius associated bacterium 3 IV 19)
- Eubostrichus topiarius 相关的细菌 1 IV 20〔说明类群〕 (Eubostrichus topiarius associated bacterium 1 IV 20)
- Olavius algarvensis 硫氧化型胞内共生体〔说明类群〕 (Olavius algarvensis sulfur-oxidizing endosymbiont)
- Perspicuibacter marinus
- Arenicella →（14种）
- E01-9C-26 海洋类群〔说明类群〕 (E01-9C-26 marine group) →（5种）
- 未培养的细菌 HERMI11〔说明类群〕 (uncultured bacterium HERMI11)
- 未培养的 γ-变形菌 HF0200 24F15〔说明类群〕 (uncultured gamma proteobacterium HF0200 24F15)
- 未培养的 γ-变形菌 HF4000 47G05〔说明类群〕 (uncultured gamma proteobacterium HF4000 47G05)
- 未培养的放线菌 HF0200 46I24〔说明类群〕 (uncultured actinobacterium HF0200 46I24)
- 未培养的细菌 KM3-174-C5〔说明类群〕 (uncultured bacterium KM3-174-C5)
- Candidatus Muproteobacteria →（15种）
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RIFCSPHIGHO2 02 FULL 65 16〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RIFCSPHIGHO2 02 FULL 65 16)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RIFCSPHIGHO2 01 FULL 65 16〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RIFCSPHIGHO2 01 FULL 65 16)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RBG 16 64 10〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RBG 16 64 10)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RBG 16 65 31〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RBG 16 65 31)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RIFCSPHIGHO2 01 60 12〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RIFCSPHIGHO2 01 60 12)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RBG 19FT COMBO 61 10〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RBG 19FT COMBO 61 10)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RIFCSPHIGHO2 02 FULL 60 13〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RIFCSPHIGHO2 02 FULL 60 13)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RBG 16 60 9〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RBG 16 60 9)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RIFCSPHIGHO2 01 FULL 61 200〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RIFCSPHIGHO2 01 FULL 61 200)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RBG 16 65 34〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RBG 16 65 34)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RBG 16 62 13〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RBG 16 62 13)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RIFCSPLOWO2 01 FULL 60 18〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RIFCSPLOWO2 01 FULL 60 18)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RBG 16 64 11〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RBG 16 64 11)
- Candidatus Muproteobacteria 细菌 RIFCSPHIGHO2 12 FULL 60 33〔说明类群〕 (Candidatus Muproteobacteria bacterium RIFCSPHIGHO2 12 FULL 60 33)
- 候选门 WS6〔说明类群〕 (Candidate division WS6) →（53种）
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 JGI CrystG Apr3-4-G16〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium JGI CrystG Apr3-4-G16)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWB1 33 6〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWB1 33 6)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWE1 36 69〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWE1 36 69)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 CG 4 10 14 0 2 um filter Dojkabacteria WS6 41 15〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium CG 4 10 14 0 2 um filter Dojkabacteria WS6 41 15)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA2022〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA2022)
- 候选门 WS6 细菌 34 10〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium 34 10)
- 候选门 WS6 细菌 RIFOXYB1 FULL 33 14〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium RIFOXYB1 FULL 33 14)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWF1 35 23〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWF1 35 23)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWF2 33 92〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWF2 33 92)
- 候选门 WS6 细菌 GWE1 33 547〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GWE1 33 547)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA4776〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA4776)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA2222〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA2222)
- 未培养的真细菌 WCHB1-06〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-06)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWE2 33 157〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWE2 33 157)
- 候选门 WS6 细菌 36 33〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium 36 33)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA5232〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA5232)
- 未培养的候选门 WS6 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division WS6 bacterium)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWF1 36 8〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWF1 36 8)
- 甲苯降解型产甲烷的联合体细菌〔说明类群〕 (toluene-degrading methanogenic consortium bacterium)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 HGW-Dojkabacteria-1〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium HGW-Dojkabacteria-1)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA4813〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA4813)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWE1 34 7〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWE1 34 7)
- 细菌富集培养克隆 E2〔说明类群〕 (bacterium enrichment culture clone E2)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 WS6 33 547〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 WS6 33 547)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA4069〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA4069)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWF1 33 233〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWF1 33 233)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWC1 33 20〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWC1 33 20)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 CG 4 9 14 3 um filter 150 Dojkabacteria WS6 41 13〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium CG 4 9 14 3 um filter 150 Dojkabacteria WS6 41 13)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA5209〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA5209)
- 细菌富集培养克隆 E1〔说明类群〕 (bacterium enrichment culture clone E1)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 CG 4 10 14 3 um filter Dojkabacteria WS6 41 9〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium CG 4 10 14 3 um filter Dojkabacteria WS6 41 9)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWC2 36 7〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWC2 36 7)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWD1 35 594〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWD1 35 594)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWC1 36 11〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWC1 36 11)
- 候选门 WS6 细菌 RIFOXYB1 FULL 33 15〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium RIFOXYB1 FULL 33 15)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA5223〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA5223)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA3081〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA3081)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA5749〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA5749)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA2259〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA2259)
- 候选门 WS6 细菌 RIFOXYD1 FULL 33 8〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium RIFOXYD1 FULL 33 8)
- 候选门 WS6 细菌 RIFOXYC1 FULL 33 10〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium RIFOXYC1 FULL 33 10)
- 候选门 WS6 细菌 GWF1 37 7〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GWF1 37 7)
- 候选门 WS6 细菌 OLB21〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium OLB21)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium)
- 候选门 WS6 细菌 OLB20〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium OLB20)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 JGI CrystG Apr3-2-B17〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium JGI CrystG Apr3-2-B17)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA2278〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA2278)
- 候选门 WS6 细菌 RIFOXYC1 FULL 33 9〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium RIFOXYC1 FULL 33 9)
- Candidatus Dojkabacteria 细菌 UBA2177〔说明类群〕 (Candidatus Dojkabacteria bacterium UBA2177)
- 未培养的真细菌 WCHB1-01〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-01)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 WS6 36 26〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 WS6 36 26)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWA2 37 6〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWA2 37 6)
- 候选门 WS6 细菌 GW2011 GWF2 39 15〔说明类群〕 (candidate division WS6 bacterium GW2011 GWF2 39 15)
- Candidatus Curculioniphilus →（9种）
- Curculio camelliae 的 Candidatus Curculioniphilus 胞内共生体〔说明类群〕 (Candidatus Curculioniphilus endosymbiont of Curculio camelliae)
- Curculio sikkimensis 的 Candidatus Curculioniphilus 胞内共生体〔说明类群〕 (Candidatus Curculioniphilus endosymbiont of Curculio sikkimensis)
- Curculio venosus 的 Candidatus Curculioniphilus buchneri 胞内共生体〔说明类群〕 (Candidatus Curculioniphilus buchneri endosymbiont of Curculio venosus)
- Pseudococcus viburni 的 γ-变形菌胞内共生体〔说明类群〕 (gamma proteobacterium endosymbiont of Pseudococcus viburni)
- Curculio glandium 的 Candidatus Curculioniphilus buchneri 胞内共生体〔说明类群〕 (Candidatus Curculioniphilus buchneri endosymbiont of Curculio glandium)
- Curculio robustus 的 Candidatus Curculioniphilus 胞内共生体〔说明类群〕 (Candidatus Curculioniphilus endosymbiont of Curculio robustus)
- Curculio pellitus 的 Candidatus Curculioniphilus buchneri 胞内共生体〔说明类群〕 (Candidatus Curculioniphilus buchneri endosymbiont of Curculio pellitus)
- Curculio dentipes 的 Candidatus Curculioniphilus 胞内共生体〔说明类群〕 (Candidatus Curculioniphilus endosymbiont of Curculio dentipes)
- Candidatus Curculioniphilus buchneri
- 西地西菌属 (Cedecea) →（12种）
- 细菌 FCC13〔说明类群〕 (bacterium FCC13)
- γ-变形菌 pp5a〔说明类群〕 (gamma proteobacterium pp5a)
- Drosicha corpulenta 的 Enterobacterial 胞内共生体〔说明类群〕 (Enterobacterial endosymbiont of Drosicha corpulenta)
- 内生生物细菌 SS06〔说明类群〕 (endophyte bacterium SS06)
- Cedecea davisae
- Cedecea davisae DSM 4568
- 细菌 ST-3-08〔说明类群〕 (bacterium ST-3-08)
- Cedecea neteri
- 内生生物细菌 SS01〔说明类群〕 (endophyte bacterium SS01)
- Drosicha pinicola 的 Enterobacterial 胞内共生体〔说明类群〕 (Enterobacterial endosymbiont of Drosicha pinicola)
- 细菌 spbL1type1-2〔说明类群〕 (bacterium spbL1type1-2)
- 内生生物细菌 SS05〔说明类群〕 (endophyte bacterium SS05)
- Candidatus Blochmannia →（27种）
- Candidatus Blochmannia vicinus
- Camponotus socius 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Camponotus socius)
- Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN
- Candidatus Blochmannia sayi
- Candidatus Blochmannia castaneus
- Candidatus Blochmannia herculeanus
- Candidatus Blochmannia novaeboracensis
- Candidatus Blochmannia vafer
- Camponotus ligniperdus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Camponotus ligniperdus)
- Candidatus Blochmannia clarithorax
- Camponotus balzani 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Camponotus balzani)
- Candidatus Blochmannia fellah
- Candidatus Blochmannia floridanus
- Candidatus Blochmannia schaefferi
- Candidatus Blochmannia laevigatus
- Candidatus Blochmannia festinatus
- Camponotus abdominalis 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Camponotus abdominalis)
- Candidatus Blochmannia pennsylvanicus
- Candidatus Blochmannia sansabeanus
- Candidatus Blochmannia americanus
- Candidatus Blochmannia chromaiodes
- Candidatus Blochmannia rufipes
- Candidatus Blochmannia nearcticus
- Candidatus Blochmannia ocreatus
- Camponotus silvicola 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Camponotus silvicola)
- Camponotus sericeiventris 的 Blochmannia 胞内共生体〔说明类群〕 (Blochmannia endosymbiont of Camponotus sericeiventris)
- Candidatus Blochmannia ulcerosus
- 特拉布斯氏菌属 (Trabulsiella) →（4种）
- 胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbionts) →（9种）
- Antonina crawii 的 gamma- 共生体〔说明类群〕 (gamma-symbiont of Antonina crawii)
- Acyrthosiphon pisum 的次级共生体 type-X〔说明类群〕 (secondary symbiont type-X of Acyrthosiphon pisum)
- Australicoccus grevilleae 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Australicoccus grevilleae)
- Crisicoccus azaleae 的 Enterobacteriaceae 细菌次级胞内共生体〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium secondary endosymbiont of Crisicoccus azaleae)
- Antonina pretiosa 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Antonina pretiosa)
- Paracoccus nothofagicola 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Paracoccus nothofagicola)
- Melanococcus albizziae 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Melanococcus albizziae)
- Cyphonococcus alpinus 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Cyphonococcus alpinus)
- Amonostherium lichtensioides 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Amonostherium lichtensioides)
- 候选门 OD1〔说明类群〕 (Candidate division OD1) →（8种）
- 未培养的 Microgenomates 类群细菌〔说明类群〕 (uncultured Microgenomates group bacterium)
- 未培养的 Crater Lake 细菌 CL500-13〔说明类群〕 (uncultured Crater Lake bacterium CL500-13)
- Planctomycete 富集培养克隆 15558〔说明类群〕 (Planctomycete enrichment culture clone 15558)
- 细菌 SH4-10〔说明类群〕 (bacterium SH4-10)
- 未培养的 Crater Lake 细菌 CL500-94〔说明类群〕 (uncultured Crater Lake bacterium CL500-94)
- 未培养的候选门 WWE3 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division WWE3 bacterium)
- 未培养的 Parcubacteria 类群细菌〔说明类群〕 (uncultured Parcubacteria group bacterium)
- 未培养的真细菌 WCHB1-58〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-58)
- TA06 →（21种）
- 候选门 TA06 细菌 ADurb.Bin417〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium ADurb.Bin417)
- 未培养的细菌 UASB 117〔说明类群〕 (uncultured bacterium UASB 117)
- 未培养的细菌 UASB TL20〔说明类群〕 (uncultured bacterium UASB TL20)
- 未培养的候选门 GN04 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division GN04 bacterium)
- 候选门 TA06 细菌 32 111〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium 32 111)
- 候选门 TA06 细菌 DG 78〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium DG 78)
- 候选门 TA06 细菌 B3 TA06〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium B3 TA06)
- 候选门 TA06 细菌 SM1 40〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium SM1 40)
- 未培养的候选门 AC1 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division AC1 bacterium)
- 未培养的候选门 TA06 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division TA06 bacterium)
- 候选门 TA06 细菌 JGI Cruoil 03 38 101〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium JGI Cruoil 03 38 101)
- 候选门 TA06 细菌〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium)
- 候选门 TA06 细菌 SM23 40〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium SM23 40)
- 候选门 TA06 细菌 DG 26〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium DG 26)
- 候选门 TA06 细菌 DG 24〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium DG 24)
- 候选门 TA06 细菌 ADurb.Bin131〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium ADurb.Bin131)
- 候选门 AC1 细菌 JGI MDM2 ZSED05-1-F8〔说明类群〕 (candidate division AC1 bacterium JGI MDM2 ZSED05-1-F8)
- 未培养的细菌 TA08〔说明类群〕 (uncultured bacterium TA08)
- 候选门 TA06 细菌 34 109〔说明类群〕 (candidate division TA06 bacterium 34 109)
- 细菌富集培养克隆 R4-85B〔说明类群〕 (bacterium enrichment culture clone R4-85B)
- 未培养的细菌 SHA-114〔说明类群〕 (uncultured bacterium SHA-114)
- 候选门 SR1〔说明类群〕 (Candidate division SR1) →（17种）
- 候选门 SR1 细菌〔说明类群〕 (candidate division SR1 bacterium)
- SR1 细菌口腔分类单元 874〔说明类群〕 (SR1 bacterium oral taxon 874)
- 未培养的细菌 VC2.1 Bac16〔说明类群〕 (uncultured bacterium VC2.1 Bac16)
- SR1 细菌人口腔分类单元 HOT-345〔说明类群〕 (SR1 bacterium human oral taxon HOT-345)
- 候选门 SR1 细菌 CG 4 9 14 3 um filter 40 9〔说明类群〕 (candidate division SR1 bacterium CG 4 9 14 3 um filter 40 9)
- 未培养的细菌 X112〔说明类群〕 (uncultured bacterium X112)
- SR1 细菌犬口腔分类单元 369〔说明类群〕 (SR1 bacterium canine oral taxon 369)
- 候选门 SR1 细菌分类单元 345〔说明类群〕 (candidate division SR1 bacterium taxon 345)
- 候选门 SR1 细菌猫口腔分类单元 313〔说明类群〕 (candidate division SR1 bacterium feline oral taxon 313)
- 未培养的候选门 SR1 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division SR1 bacterium)
- 候选门 SR1 细菌 MGEHA〔说明类群〕 (candidate division SR1 bacterium MGEHA)
- SR1 细菌人口腔分类单元 HOT-874〔说明类群〕 (SR1 bacterium human oral taxon HOT-874)
- 候选门 SR1 细菌 RAAC1 SR1 1〔说明类群〕 (candidate division SR1 bacterium RAAC1 SR1 1)
- 候选门 SR1 细菌 Aalborg AAW-1〔说明类群〕 (candidate division SR1 bacterium Aalborg AAW-1)
- SR1 细菌犬口腔分类单元 382〔说明类群〕 (SR1 bacterium canine oral taxon 382)
- SR1 细菌犬口腔分类单元 380〔说明类群〕 (SR1 bacterium canine oral taxon 380)
- SR1 细菌口腔分类单元 875〔说明类群〕 (SR1 bacterium oral taxon 875)
- · 装甲菌门 (Armatimonadetes) →（20种）
- Chthonomonadetes →（4种）
- Armatimonadia →（4种）
- 候选门 OP10 克隆 OPB50〔说明类群〕 (candidate division OP10 clone OPB50)
- 未培养的细菌 SBR1039〔说明类群〕 (uncultured bacterium SBR1039)
- 未培养的细菌 SJA-171〔说明类群〕 (uncultured bacterium SJA-171)
- 人参土菌毛单胞菌〔种〕 (Fimbriimonas ginsengisoli)
- 未培养的细菌 #0319-6E2〔说明类群〕 (uncultured bacterium #0319-6E2)
- 未培养的细菌 SJA-176〔说明类群〕 (uncultured bacterium SJA-176)
- 未培养的细菌 SJA-43〔说明类群〕 (uncultured bacterium SJA-43)
- 未培养的细菌 SJA-121〔说明类群〕 (uncultured bacterium SJA-121)
- 未培养的细菌 #0319-6A24〔说明类群〕 (uncultured bacterium #0319-6A24)
- 未培养的 Armatimonadetes 细菌〔说明类群〕 (uncultured Armatimonadetes bacterium)
- 未培养的细菌 GC55〔说明类群〕 (uncultured bacterium GC55)
- 未培养的候选门 WS1 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division WS1 bacterium)
- 布丘氏菌属 (Buttiauxella) →（12种）
- Buttiauxella noackiae
- · 田野布丘氏菌 (Buttiauxella agrestis)
- Buttiauxella izardii
- Buttiauxella warmboldiae
- Buttiauxella chrysanthemi
- Buttiauxella agrestis ATCC 33320
- 细菌 fjat-scr-2〔说明类群〕 (bacterium fjat-scr-2)
- 细菌 8-gw1-1〔说明类群〕 (bacterium 8-gw1-1)
- Buttiauxella brennerae
- Buttiauxella gaviniae
- 细菌 LMG 5339〔说明类群〕 (bacterium LMG 5339)
- Buttiauxella ferragutiae
- Candidatus Macropleicola →（2种）
- 候选门 BRC1〔说明类群〕 (Candidate division BRC1) →（16种）
- Candidatus Sumerlaeia →（2种）
- 未培养的土壤的细菌 PBS-III-29〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-III-29)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-III-18〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-III-18)
- 未培养的 Candidatus Sumerlaeota 细菌〔说明类群〕 (uncultured Candidatus Sumerlaeota bacterium)
- 未培养的 Hydrogenedentes 细菌〔说明类群〕 (uncultured Hydrogenedentes bacterium)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-II-1〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-II-1)
- 未培养的土壤的细菌 PRR-11〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PRR-11)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-II-34〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-II-34)
- 未培养的细菌 SJP-3〔说明类群〕 (uncultured bacterium SJP-3)
- 未培养的深海的细菌〔说明类群〕 (uncultured deep-sea bacterium)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-III-24〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-III-24)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-II-4〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-II-4)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-III-4〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-III-4)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-74〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-74)
- 未培养的细菌 SJP-2〔说明类群〕 (uncultured bacterium SJP-2)
- SC3-20 →（3种）
- KI89A 演化支〔说明类群〕 (KI89A clade) →（3种）
- Pseudocitrobacter →（2种）
- NKB5 →（3种）
- Thorselliaceae →（5种）
- BD1-5 →（2,235种）
- Parcubacteria 类群〔说明类群〕 (Parcubacteria group) →（1,426种）
- Candidatus Uhrbacteria →（84种）
- Candidatus Parcubacteria →（2种）
- Candidatus Falkowbacteria →（68种）
- Candidatus Staskawiczbacteria →（44种）
- Candidatus Harrisonbacteria →（17种）
- Candidatus Tagabacteria →（9种）
- Candidatus Colwellbacteria →（16种）
- Candidatus Taylorbacteria →（45种）
- Candidatus Nealsonbacteria →（68种）
- Candidatus Azambacteria →（42种）
- Candidatus Campbellbacteria →（16种）
- Candidatus Veblenbacteria →（6种）
- Candidatus Wolfebacteria →（41种）
- Candidatus Yanofskybacteria →（83种）
- Candidatus Portnoybacteria →（40种）
- Candidatus Brennerbacteria →（8种）
- Candidatus Terrybacteria →（11种）
- Candidatus Wildermuthbacteria →（29种）
- Candidatus Komeilibacteria →（19种）
- Candidatus Kaiserbacteria →（86种）
- Candidatus Buchananbacteria →（22种）
- Candidatus Zambryskibacteria →（61种）
- Candidatus Yonathbacteria →（24种）
- Candidatus Sungbacteria →（24种）
- Candidatus Ryanbacteria →（21种）
- Candidatus Lloydbacteria →（15种）
- Candidatus Adlerbacteria →（15种）
- Candidatus Spechtbacteria →（9种）
- Candidatus Giovannonibacteria →（66种）
- Candidatus Niyogibacteria →（6种）
- Candidatus Kuenenbacteria →（20种）
- Candidatus Andersenbacteria →（10种）
- Candidatus Nomurabacteria →（153种）
- Candidatus Jorgensenbacteria →（23种）
- Candidatus Vogelbacteria →（13种）
- Candidatus Moranbacteria →（86种）
- Candidatus Kerfeldbacteria →（16种）
- Candidatus Liptonbacteria →（14种）
- Candidatus Jacksonbacteria →（13种）
- Candidatus Magasanikbacteria →（81种）
- Microgenomates 类群〔说明类群〕 (Microgenomates group) →（795种）
- Candidatus Woesebacteria →（158种）
- Candidatus Chisholmbacteria →（6种）
- Candidatus Daviesbacteria →（63种）
- Candidatus Shapirobacteria →（44种）
- Candidatus Gottesmanbacteria →（66种）
- Candidatus Blackburnbacteria →（13种）
- Candidatus Curtissbacteria →（53种）
- Candidatus Woykebacteria →（15种）
- Candidatus Roizmanbacteria →（132种）
- Candidatus Collierbacteria →（53种）
- Candidatus Levybacteria →（91种）
- Candidatus Pacebacteria →（36种）
- Candidatus Amesbacteria →（37种）
- Candidatus Beckwithbacteria →（26种）
- Candidatus Microgenomatus auricola
- Candidatus Cerribacteria 细菌 Amazon FNV 2010 28 9〔说明类群〕 (Candidatus Cerribacteria bacterium Amazon FNV 2010 28 9)
- Gracilibacteria 细菌口腔分类单元 873〔说明类群〕 (Gracilibacteria bacterium oral taxon 873)
- 未培养的 Candidatus Gracilibacteria 细菌〔说明类群〕 (uncultured Candidatus Gracilibacteria bacterium)
- Gracilibacteria 细菌口腔分类单元 871〔说明类群〕 (Gracilibacteria bacterium oral taxon 871)
- 未培养的候选门 GN10 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division GN10 bacterium)
- Gracilibacteria 细菌犬口腔分类单元 291〔说明类群〕 (Gracilibacteria bacterium canine oral taxon 291)
- Gracilibacteria 细菌犬口腔分类单元 394〔说明类群〕 (Gracilibacteria bacterium canine oral taxon 394)
- 未培养的细菌 GKS2-30〔说明类群〕 (uncultured bacterium GKS2-30)
- Gracilibacteria 细菌犬口腔分类单元 364〔说明类群〕 (Gracilibacteria bacterium canine oral taxon 364)
- Gracilibacteria 细菌犬口腔分类单元 323〔说明类群〕 (Gracilibacteria bacterium canine oral taxon 323)
- 细菌 WH3-1〔说明类群〕 (bacterium WH3-1)
- Candidatus Altimarinus pacificus
- 未培养的细菌 GKS2-174〔说明类群〕 (uncultured bacterium GKS2-174)
- 混合培养物分离株 koll6〔说明类群〕 (mixed culture isolate koll6)
- Gracilibacteria 细菌口腔分类单元 872〔说明类群〕 (Gracilibacteria bacterium oral taxon 872)
- Parcubacteria 类群〔说明类群〕 (Parcubacteria group) →（1,426种）
- Candidatus Lambdaproteobacteria →（6种）
- Candidatus Lambdaproteobacteria 细菌 RIFOXYD12 FULL 49 8〔说明类群〕 (Candidatus Lambdaproteobacteria bacterium RIFOXYD12 FULL 49 8)
- Candidatus Lambdaproteobacteria 细菌 RIFOXYD1 FULL 56 27〔说明类群〕 (Candidatus Lambdaproteobacteria bacterium RIFOXYD1 FULL 56 27)
- Candidatus Lambdaproteobacteria 细菌 RIFOXYD2 FULL 56 26〔说明类群〕 (Candidatus Lambdaproteobacteria bacterium RIFOXYD2 FULL 56 26)
- Candidatus Lambdaproteobacteria 细菌〔说明类群〕 (Candidatus Lambdaproteobacteria bacterium)
- Candidatus Lambdaproteobacteria 细菌 RIFOXYC1 FULL 56 13〔说明类群〕 (Candidatus Lambdaproteobacteria bacterium RIFOXYC1 FULL 56 13)
- Candidatus Lambdaproteobacteria 细菌 RIFOXYD2 FULL 50 16〔说明类群〕 (Candidatus Lambdaproteobacteria bacterium RIFOXYD2 FULL 50 16)
- Orbaceae →（21种）
- Gilliamella →（16种）
- Enterobacteriaceae 细菌 Acj 122〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium Acj 122)
- Frischella perrara
- Pasteurellaceae 细菌 Lv2〔说明类群〕 (Pasteurellaceae bacterium Lv2)
- Gilliamella bombi
- Enterobacteriaceae 细菌 Acj 201〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium Acj 201)
- Enterobacteriaceae 细菌 Acj 204〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium Acj 204)
- Gilliamella mensalis
- γ-变形菌 PEB0169〔说明类群〕 (gamma proteobacterium PEB0169)
- γ-变形菌 PEB0174〔说明类群〕 (gamma proteobacterium PEB0174)
- Gilliamella intestini
- Stomaphis quercus 的次级共生体〔说明类群〕 (secondary symbiont of Stomaphis quercus)
- Gilliamella apicola
- Stomaphis longirostris 的次级共生体〔说明类群〕 (secondary symbiont of Stomaphis longirostris)
- Pasteurellaceae 细菌 Trm1〔说明类群〕 (Pasteurellaceae bacterium Trm1)
- Gilliamella bombicola
- Gilliamella apis
- Orbus →（2种）
- 未培养的〔说明类群〕 (uncultured) →（2种）
- Candidatus Schmidhempelia bombi
- Gilliamella →（16种）
- Sva0071 →（2种）
- Caldisericales →（5种）
- 候选门 OP3〔说明类群〕 (Candidate division OP3) →（5种）
- Omnitrophica 克隆 OPB2〔说明类群〕 (Omnitrophica clone OPB2)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-87〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-87)
- 混合培养物分离株 koll11〔说明类群〕 (mixed culture isolate koll11)
- 未培养的 Banisveld 填埋场的细菌 BVC56〔说明类群〕 (uncultured Banisveld landfill bacterium BVC56)
- 未培养的 Omnitrophica 细菌〔说明类群〕 (uncultured Omnitrophica bacterium)
- 拉乌尔菌属 (Raoultella) →（20种）
- 细菌富集培养克隆 MW-11〔说明类群〕 (bacterium enrichment culture clone MW-11)
- Raoultella ornithinolytica
- Enterobacteriaceae 细菌菌株 FGI 57〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium strain FGI 57)
- 细菌 060620-Aspo-KJ0052F01-A1-AM1〔说明类群〕 (bacterium 060620-Aspo-KJ0052F01-A1-AM1)
- 细菌 LF74〔说明类群〕 (bacterium LF74)
- 固氮的细菌 CANF3〔说明类群〕 (nitrogen-fixing bacterium CANF3)
- 细菌 SV6XVII〔说明类群〕 (bacterium SV6XVII)
- Raoultella planticola ATCC 33531
- Raoultella electrica
- 细菌 spb30B3-5〔说明类群〕 (bacterium spb30B3-5)
- 细菌 SV73A〔说明类群〕 (bacterium SV73A)
- 细菌 LF53〔说明类群〕 (bacterium LF53)
- Enterobacteriaceae 细菌 A47 2010〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium A47 2010)
- Eurydema rugosa 的 Enterobacteriaceae 细菌共生体〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium symbiont of Eurydema rugosa)
- Enterobacteriaceae 细菌 A52 2010〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium A52 2010)
- 细菌 LF78〔说明类群〕 (bacterium LF78)
- Eurydema dominulus 的 Enterobacteriaceae 细菌共生体〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium symbiont of Eurydema dominulus)
- Raoultella ornithinolytica 10-5246
- 细菌 B1 2009〔说明类群〕 (bacterium B1 2009)
- Enterobacteriaceae 细菌 A45 2010〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium A45 2010)
- Candidatus Steffania →（3种）
- Bacterium →（5种）
- BD7-8 海洋类群〔说明类群〕 (BD7-8 marine group) →（6种）
- Olavius algarvensis Gamma 3 胞内共生体〔说明类群〕 (Olavius algarvensis Gamma 3 endosymbiont)
- Alviniconcha hessleri 鳃的胞内共生体〔说明类群〕 (Alviniconcha hessleri gill endosymbiont)
- Olavius ilvae Gamma 3 胞内共生体〔说明类群〕 (Olavius ilvae Gamma 3 endosymbiont)
- Ifremeria nautilei 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Ifremeria nautilei)
- Ifremeria nautilei 鳃的共生体〔说明类群〕 (Ifremeria nautilei gill symbiont)
- 未培养的南极海冰的细菌〔说明类群〕 (uncultured Antarctic sea ice bacterium)
- 候选门 OP11〔说明类群〕 (Candidate division OP11) →（9种）
- 细菌富集培养克隆 AOM-SR-B28〔说明类群〕 (bacterium enrichment culture clone AOM-SR-B28)
- Microgenomates 细菌克隆 OPB92〔说明类群〕 (Microgenomates bacterium clone OPB92)
- 未培养的细菌 GR-296.II.4A〔说明类群〕 (uncultured bacterium GR-296.II.4A)
- 未培养的真细菌 WCHB1-64〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-64)
- 未培养的真细菌 WCHB1-56〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-56)
- 未培养的真细菌 WCHB1-07〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-07)
- 未培养的 Anaerolineales 细菌〔说明类群〕 (uncultured Anaerolineales bacterium)
- 未培养的真细菌 WCHB1-11〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-11)
- 未培养的真细菌 WCHB1-26〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-26)
- TA18 →（3种）
- 布戴约维采菌科 (Budviciaceae) →（6种）
- 摩根氏菌属 (Morganella) →（3种）
- 候选门 OP9〔说明类群〕 (Candidate division OP9) →（3种）
- Candidatus Vidania →（4种）
- 候选门 OP8〔说明类群〕 (Candidate division OP8) →（5种）
- Aminicenantes 细菌克隆 OPB95〔说明类群〕 (Aminicenantes bacterium clone OPB95)
- 未培养的细菌 SHA-89〔说明类群〕 (uncultured bacterium SHA-89)
- Aminicenantes 细菌克隆 OPB5〔说明类群〕 (Aminicenantes bacterium clone OPB5)
- 未培养的 Aminicenantes 细菌〔说明类群〕 (uncultured Aminicenantes bacterium)
- 未培养的细菌 UASB TL56〔说明类群〕 (uncultured bacterium UASB TL56)
- Candidatus Schneideria →（5种）
- Candidatus Schneideria nysicola
- Aphalaroida inermis 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Aphalaroida inermis)
- Candidatus Ischnodemia utricula
- Polyrhachis foreli 的 Blochmannia 胞内共生体〔说明类群〕 (Blochmannia endosymbiont of Polyrhachis foreli)
- Pseudolynchia canariensis 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Pseudolynchia canariensis)
- RF3 →（3种）
- TM6 →（10种）
- 未培养的 Nautiliales 细菌〔说明类群〕 (uncultured Nautiliales bacterium)
- 未培养的细菌 SBRH58〔说明类群〕 (uncultured bacterium SBRH58)
- 未培养的细菌 VC2.1 Bac35〔说明类群〕 (uncultured bacterium VC2.1 Bac35)
- Candidatus Babeliaceae 细菌〔说明类群〕 (Candidatus Babeliaceae bacterium)
- Candidatus Babela massiliensis
- Vermiphilus pyriformis
- Verrucomicrobia 细菌 YJF2-48〔说明类群〕 (Verrucomicrobia bacterium YJF2-48)
- 未培养的细菌 C1-3〔说明类群〕 (uncultured bacterium C1-3)
- 未培养的 Candidatus Dependentiae 细菌〔说明类群〕 (uncultured Candidatus Dependentiae bacterium)
- 未培养的细菌 VC2.1 Bac47〔说明类群〕 (uncultured bacterium VC2.1 Bac47)
- 克吕沃尔氏菌属 (Kluyvera) →（12种）
- Kluyvera ascorbata ATCC 33433
- γ-变形菌 P8〔说明类群〕 (gamma proteobacterium P8)
- 细菌 F5 2009〔说明类群〕 (bacterium F5 2009)
- γ-变形菌 RBE1CD-97〔说明类群〕 (gamma proteobacterium RBE1CD-97)
- 虹鳟肠道的细菌 D211〔说明类群〕 (rainbow trout intestinal bacterium D211)
- γ-变形菌 RBE2CD-94〔说明类群〕 (gamma proteobacterium RBE2CD-94)
- Lelliottia amnigena
- Kluyvera ascorbata
- · 中间克吕沃尔氏菌 (Kluyvera intermedia)
- Kluyvera georgiana
- 细菌 hswx111〔说明类群〕 (bacterium hswx111)
- γ-变形菌 RBE2CD-47〔说明类群〕 (gamma proteobacterium RBE2CD-47)
- HOC36 →（5种）
- 内生的细菌 CR1b〔说明类群〕 (endophytic bacterium CR1b)
- Candidatus Purcelliella pentastirinorum
- Colobopsis shohki 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Colobopsis shohki)
- Serratia marcescens W2.3
- Enterobacteriaceae 细菌富集培养克隆 AP-FeEnrich23〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium enrichment culture clone AP-FeEnrich23)
- Formica fusca 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Formica fusca)
- Thermotogales str. BHI80-139
- 未培养的 Banisveld 填埋场的细菌 BVB22〔说明类群〕 (uncultured Banisveld landfill bacterium BVB22)
- Aquamonas haywardensis
- Liposcelis decolor 宿主种群 HNZZ 的初级胞内共生体〔说明类群〕 (primary endosymbiont of Liposcelis decolor host pop. HNZZ)
- Candidatus Kleidoceria schneideri
- Polyrhachis ypsilon 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Polyrhachis ypsilon)
- Curculio hachijoensis 的 Sodalis 胞内共生体〔说明类群〕 (Sodalis endosymbiont of Curculio hachijoensis)
- Escherichia marmotae
- 未培养的候选门 WS5 细菌〔说明类群〕 (uncultured candidate division WS5 bacterium)
- 未培养的细菌 GKS2-91〔说明类群〕 (uncultured bacterium GKS2-91)
- 未培养的土壤的细菌 PBS-25〔说明类群〕 (uncultured soil bacterium PBS-25)
- Immundisolibacter cernigliae
- Candidatus Benitsuchiphilus tojoi
- Polyrhachis dives 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Polyrhachis dives)
- Heteropsylla cubana 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana)
- Gibbsiella greigii
- Enterobacter hormaechei ATCC 49162
- Ctenarytaina eucalypti 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Ctenarytaina eucalypti)
- Serratia entomophila
- 细菌 NTL237〔说明类群〕 (bacterium NTL237)
- Acidihalobacter prosperus
- 细菌 NTL344〔说明类群〕 (bacterium NTL344)
- Enterobacteriaceae 细菌 UYSO8〔说明类群〕 (Enterobacteriaceae bacterium UYSO8)
- Polyrhachis hippomanes 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Polyrhachis hippomanes)
- Marinagarivorans algicola
- 细菌 NTL235〔说明类群〕 (bacterium NTL235)
- Plagiolepis manczshurica 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Plagiolepis manczshurica)
- 未培养的 Chromatiales 细菌〔说明类群〕 (uncultured Chromatiales bacterium)
- γ-变形菌 SS-5〔说明类群〕 (gamma proteobacterium SS-5)
- Calophya schini 的次级胞内共生体〔说明类群〕 (secondary endosymbiont of Calophya schini)
- Candidatus Stammerula tephritidis
- Superficieibacter electus
- Olavius crassitunicatus γ-变形菌的胞内共生体〔说明类群〕 (Olavius crassitunicatus gamma-proteobacterial endosymbiont)
- 未培养的真细菌 WCHB1-60〔说明类群〕 (uncultured eubacterium WCHB1-60)
- Colobopsis nipponicus 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Colobopsis nipponicus)
- 细菌 S13Fe21〔说明类群〕 (bacterium S13Fe21)
- Biostraticola tofi
- Plagiolepis pigmaea 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Plagiolepis pigmaea)
- 未培养的细菌 W4-21b〔说明类群〕 (uncultured bacterium W4-21b)
- Enterobacillus tribolii
- Rhodothermia 细菌〔说明类群〕 (Rhodothermia bacterium)
- Nippolachnus piri 的类似 Sodalis 的共生体〔说明类群〕 (Sodalis-like symbiont of Nippolachnus piri)
- Limnobaculum parvum
- Candidatus Westeberhardia cardiocondylae
- Heliothis virescens 精巢的胞内共生体〔说明类群〕 (Heliothis virescens testis endosymbiont)
- Polyrhachis lamellidens 的胞内共生体〔说明类群〕 (endosymbiont of Polyrhachis lamellidens)
- 未培养的厌氧的细菌〔说明类群〕 (uncultured anaerobic bacterium)
- 细菌富集培养克隆 E26〔说明类群〕 (bacterium enrichment culture clone E26)
- 类志贺邻单胞菌〔种〕 (Plesiomonas shigelloides)
- 细菌 NTL338〔说明类群〕 (bacterium NTL338)
- 未命名类群 2782 →（56,862种）
- 古菌和真核生物〔说明类群〕 →（2,175,434种）